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합성하려는 올리고의 정제를 선택할 때는 다음의 여러 요소들을 고려해야 합니다.
* 사용하려는 올리고의 application
* 합성 하려는 올리고의 길이
* 올리고가 어떤 수식을 포함하고 있는지 여부
* 얼마나 많은 양이 필요한지 여부
PCR 또는 Sequencing 용
모든 올리고에 기본으로 제공되는 Standard desalting 만으로도 충분합니다. Deletion product는 full length oligo에 비해 극히 드물며, truncation은 보통 5'end strand에 발행되므로 항상 intact하게 존재하는 3'end 는 일반적인 PCR 관련 실험에서는 전혀 문제가 되지 않습니다.
Cloning, mutagenesis, gel shift 용
이러한 application들은 모두 full length product가 매우 중요합니다. 따라서 PAGE purification을 매우 권장합니다. PAGE 정제를 하게 되면 최상의 purity를 제공하며 최소 85% 이상의 full length product 순도를 갖게 됩니다. 하지만 PAGE 정제는 HPLC 정제보다 최종 수율이 낮으므로 purity 높으면서 수율도 높은 제품을 원한다면 HPLC 정제를 권합니다.
Modified Oligos: 수식 합성 올리고
PAGE 정제시 사용되는 UREA는 특정 수식들 특히 형광물질 및 attachment 물질에 damage를 줄 수 있습니다. 따라서 any fluorophore, amino modifiers, digoxigenin, I-linker, thiol modifier 등에는 PAGE 정제를 피하고 HPLC 정제를 하는 것이 좋습니다.
이 외에 많은 변수가 있을 수 있으므로 상세한 문의는
idt@mbiotech.co.kr 또는 031-556-3905로 주시면 정확한 답변을 드리도록 하겠습니다.
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